Алгоритм поиска иммунодоминантных эпитопов in silico для иммунодиагностики вакциноуправляемых инфекций
Цыганков А.М., Янченко В.В.
Витебский государственный медицинский университет, Витебск, Беларусь
В данной публикации приводится алгоритм выбора иммунодоминантных эпитопов, которые являются участками белков вирусов гриппа, используемых при вакцинации в 2023-2024 годах с целью использования в иммунодиагностике. С помощью различных программ удалённого доступа реализован алгоритм поиска иммунодоминантных эпитопов исходя из анализа аминокислотной последовательности белков вирусов, входящих в состав вакцин, реализуемых в Республике Беларусь. В результате проделанной работы выбрано 10 иммунодоминантных эпитопов из 96 эпитопов вируса гриппа. Это является шагом перед синтезом пептидов для лабораторной диагностики клеточного ответа системы иммунитета на вакцину против вируса, а также после перенесённой инфекции. Так, различный набор пептидов позволяет выявлять ответ системы иммунитета на поверхностные белки вирусов из вакцин «Гриппол», «Ваксигрипп Тетра», «Инфлювак Тетра» либо на другие белки вирусов гриппа в случае болезни, что является дополнительным исследованием после оценки гуморального ответа в виде нейтрализующих антител на гемагглютинин. |